MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1 plasmid pAph02

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013190	GAC	2	6	3562	3567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013190	GCC	2	6	5721	5726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_013190	CGC	2	6	5762	5767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_013190	CCG	2	6	5774	5779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_013190	GCC	2	6	5789	5794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_013190	AAC	2	6	5822	5827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013190	AAC	2	6	5844	5849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013190	A	7	7	5853	5859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013190	AAC	2	6	5865	5870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013190	AAC	2	6	5876	5881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013190	AAC	2	6	5908	5913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013190	GTC	2	6	5961	5966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013190	CTT	2	6	5967	5972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013190	CGC	2	6	6036	6041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_013190	CAAG	2	8	6056	6063	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013190	GCC	2	6	6075	6080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_013190	G	6	6	6197	6202	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013190	GGA	2	6	6289	6294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013190	TAC	2	6	6898	6903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013190	GACCTG	2	12	6931	6942	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013190	CGG	2	6	7208	7213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013190	ATCGC	2	10	7214	7223	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_013190	TGCC	2	8	7270	7277	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013190	GGC	2	6	7321	7326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013190	GAC	2	6	7402	7407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013190	GCG	2	6	7867	7872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013190	GC	3	6	7879	7884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013190	CAG	2	6	7939	7944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013190	ACC	2	6	7945	7950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_013190	AGC	2	6	8003	8008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013190	TCGT	2	8	8040	8047	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013190	ATC	2	6	8094	8099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013190	A	6	6	8121	8126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013190	TTC	2	6	8127	8132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013190	ACA	2	6	13926	13931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013190	CGC	2	6	13942	13947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_013190	TCG	2	6	13948	13953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013190	GGC	2	6	14097	14102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013190	TGAC	2	8	14112	14119	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013190	CGG	2	6	14191	14196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013190	CGTGAT	2	12	14227	14238	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_013190	TCA	2	6	14320	14325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013190	A	8	8	14327	14334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013190	TAG	2	6	14345	14350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013190	GGT	2	6	14447	14452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013190	GGT	2	6	14473	14478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013190	TCT	2	6	14510	14515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013190	CTG	2	6	14529	14534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013190	ACA	2	6	14547	14552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013190	CAT	2	6	14565	14570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013190	TTG	2	6	14613	14618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013190	GATG	2	8	14631	14638	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013190	CTT	2	6	14647	14652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013190	GGC	2	6	14657	14662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013190	CAG	2	6	14720	14725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013190	TATCC	2	10	16139	16148	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_013190	GGATA	2	10	16153	16162	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013190	GCCG	2	8	16207	16214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013190	GC	3	6	16243	16248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013190	GGC	3	9	16274	16282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013190	GTG	2	6	16329	16334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013190	TGC	2	6	16368	16373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013190	GGA	2	6	16376	16381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013190	ATG	2	6	16493	16498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013190	AC	3	6	16508	16513	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013190	TTG	2	6	16613	16618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013190	CAG	2	6	16710	16715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013190	GCG	2	6	16781	16786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013190	CGG	2	6	16813	16818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013190	CTT	2	6	17496	17501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013190	GCC	2	6	17590	17595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_013190	TGC	2	6	17596	17601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013190	CCA	2	6	17602	17607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_013190	C	6	6	17659	17664	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
75	NC_013190	CGC	2	6	17723	17728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_013190	CAA	2	6	17765	17770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013190	CGTC	2	8	17775	17782	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013190	CAT	2	6	17885	17890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013190	CGC	2	6	17953	17958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_013190	GCA	2	6	18109	18114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013190	GTA	2	6	18137	18142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013190	CTG	2	6	18173	18178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013190	AGC	2	6	18207	18212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013190	GCC	2	6	18223	18228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_013190	CCGG	2	8	18980	18987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013190	AC	3	6	18990	18995	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013190	CGG	2	6	21651	21656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013190	TC	3	6	21683	21688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013190	GGC	2	6	21744	21749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013190	CGG	2	6	21784	21789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013190	GC	3	6	21816	21821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_013190	CAA	2	6	21831	21836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013190	GCC	2	6	21871	21876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_013190	TCA	2	6	23208	23213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013190	AAT	2	6	28160	28165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013190	CGAA	2	8	29065	29072	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_013190	GCA	2	6	29081	29086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013190	GCA	2	6	29104	29109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013190	GTA	2	6	29132	29137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013190	GAC	2	6	29157	29162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013190	GAA	2	6	29266	29271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013190	GGC	2	6	29283	29288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013190	GTGCT	2	10	29318	29327	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_013190	CGGT	2	8	29338	29345	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_013190	CGG	2	6	29427	29432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013190	CCTCC	2	10	29527	29536	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
107	NC_013190	GTG	2	6	29576	29581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013190	TGA	2	6	29637	29642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013190	GCT	2	6	31333	31338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013190	GCG	2	6	31385	31390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013190	TGTA	2	8	32051	32058	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013190	AAC	2	6	32205	32210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013190	ACC	2	6	32230	32235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_013190	TTCA	2	8	32274	32281	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013190	GGT	2	6	32287	32292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013190	CCA	2	6	33174	33179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_013190	GTAGG	2	10	33181	33190	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013190	TTA	2	6	34326	34331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013190	AC	3	6	34389	34394	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013190	AC	3	6	34411	34416	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013190	AC	3	6	34433	34438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_013190	T	6	6	34459	34464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013190	GTT	2	6	34540	34545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013190	AGCC	2	8	34553	34560	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013190	ACC	2	6	34570	34575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_013190	CAAC	2	8	34601	34608	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_013190	CCG	2	6	34672	34677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_013190	CGGG	2	8	34767	34774	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013190	CGG	2	6	34853	34858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013190	G	6	6	34857	34862	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013190	G	6	6	35775	35780	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013190	CT	3	6	35856	35861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_013190	GC	3	6	35878	35883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_013190	GCG	3	9	36009	36017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013190	GTTT	2	8	36034	36041	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013190	TTA	2	6	36092	36097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013190	ATA	2	6	36100	36105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013190	TTC	2	6	36823	36828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013190	TCG	3	9	36835	36843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013190	CG	3	6	36842	36847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013190	G	6	6	36847	36852	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013190	GGC	2	6	36879	36884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_013190	ACG	2	6	36899	36904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_013190	GTT	2	6	36915	36920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013190	GTT	2	6	36949	36954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013190	CCG	2	6	36970	36975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_013190	GTG	2	6	36999	37004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013190	GTTTT	2	10	37018	37027	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013190	GCC	2	6	37074	37079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_013190	CGG	2	6	37091	37096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_013190	GCA	2	6	37106	37111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_013190	CGT	2	6	37115	37120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_013190	AAGCG	2	10	37126	37135	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
154	NC_013190	GC	3	6	37228	37233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155	NC_013190	CGG	2	6	37269	37274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_013190	AGGC	2	8	37284	37291	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
157	NC_013190	GCG	2	6	37349	37354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_013190	TGCC	2	8	37359	37366	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
159	NC_013190	CCG	2	6	37534	37539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_013190	CGC	2	6	37562	37567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_013190	CACGCC	2	12	37592	37603	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_013190	GCA	2	6	37630	37635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_013190	CCCA	2	8	37657	37664	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
164	NC_013190	CTG	2	6	37726	37731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_013190	CACC	2	8	37796	37803	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
166	NC_013190	TGC	2	6	42228	42233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.